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Nature Methods:一细胞,双视角!SDR-seq高通量解析遗传变异对基因表达的精细调控

SDR-seq技术的出现,为我们提供了一个前所未有的新“罗盘”。它不仅能将我们精确地导航到那片森林,还能让我们直接走进每一户人家,亲眼看到他们的炉灶 (基因型) 和锅里煮着的食物 (基因表达)。

2025-09-04

Nature Methods:当深度学习遇见纯净数据,DeepMVP为精准医学画出蛋白质功能新图谱

研究人员将DeepMVP应用于癌症基因组图谱(TCGA)中超过79万个癌症体细胞突变,预测发现其中高达31%的突变会显著改变PTM。

2025-08-30

Nature Methods:解密大脑“社交网络”——我们真的读懂了脑信号的“悄悄话”吗?

该研究揭示了主流功能连接方法主要捕捉的是冗余信息存储。未来的研究需要更积极地拥抱能够分解协同、冗余和独特信息流的先进框架,从而更深入地理解大脑是如何进行计算和涌现出智能的。

2025-06-18

Nature Methods:算法的胜利!不更换硬件,如何将成像质谱流式(IMC)分辨率推向350纳米?

研究团队巧妙地“绕过”了硬件的限制,通过一种创新的“过采样-再重建”策略,将成像质谱流式技术(IMC)的分辨率提升到了惊人的350纳米(nm)以下,成功推开了通往细胞内部纳米世界的大门。

2025-11-04

Nature Methods:化繁为简!nELISA如何以可扩展、低成本的方案开启精准蛋白质组学研究新纪元

nELISA的问世,不仅仅是又一项高性能分析工具的诞生。它通过一系列巧妙的设计,成功地在多重性、特异性、通量、灵敏度和成本效益这几个长期以来相互制约的维度之间,找到了一个前所未有的最佳平衡点。

2025-11-12

Nature Methods:解码肿瘤的“千人千面”——Clonalscope,一把洞悉癌细胞演化迷局的钥匙

在与癌症的漫长博弈中,我们第一次拥有了如此清晰的视野,去洞察对手的“千人千面”。而这,仅仅是一个开始。

2025-09-24

Nature Methods:超越形态学边界——GHIST深度学习框架实现从细胞结构到基因功能的精准预测

GHIST的出现,为我们描绘了一幅计算病理学的未来图景。在这个未来里,每一张被存放在医院档案室里、积满灰尘的H&E病理切片,都有可能被重新唤醒,转化为蕴含着丰富基因信息的数字宝藏。

2025-09-22

Nature Methods :“垃圾”数据里掘金!流式细胞术迎来革命,解锁百万细胞互作的秘密语言

研究团队开发出一种名为“互作组学”的创新框架。它巧妙地利用了成熟的流式细胞术(flow cytometry),以惊人的速度、超高的通量和极低的成本,实现了对细胞间物理互动的精准捕获和定量分析。

2025-08-10

Nature Methods:从模糊到清晰!绘制单神经元连接组,迈向理解大脑疾病的关键一步

这项研究的贡献是里程碑式的。它为我们提供了一种强大而可靠的框架,来构建和验证单神经元分辨率的全脑连接组。

2025-08-29

Nature Methods:超声版“GFP”家族扩容——告别“单色”超声,工程化气囊蛋白开启深层组织多重基因成像新纪元

研究人员开发出了两类具有不同声学响应特性的声学报告基因(ARGs)。这相当于给了超声波两种不同的“颜色”,让我们第一次有能力在深层活体组织中,同时聆听并区分来自不同细胞群体的声音。

2025-11-22